MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	TGT	2	6	30985	30990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102434
502	NC_011981	GAT	2	6	31095	31100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102434
503	NC_011981	GCT	2	6	31375	31380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102435
504	NC_011981	ACG	2	6	31424	31429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102435
505	NC_011981	CGG	2	6	31465	31470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102435
506	NC_011981	TCGCC	2	10	31522	31531	0 %	20 %	20 %	60 %	222102435
507	NC_011981	AC	3	6	31536	31541	50 %	0 %	0 %	50 %	222102435
508	NC_011981	GGC	2	6	31621	31626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102435
509	NC_011981	CCG	2	6	31629	31634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102435
510	NC_011981	AGG	2	6	31644	31649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102435
511	NC_011981	GAA	2	6	32010	32015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102436
512	NC_011981	TCT	2	6	32040	32045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102436
513	NC_011981	ACC	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102436
514	NC_011981	GAAAT	2	10	32111	32120	60 %	20 %	20 %	0 %	222102436
515	NC_011981	CCG	2	6	32171	32176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102436
516	NC_011981	CTC	2	6	32182	32187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102436
517	NC_011981	GC	3	6	32201	32206	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
518	NC_011981	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
519	NC_011981	CGC	2	6	32331	32336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102436
520	NC_011981	TGG	2	6	32351	32356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102436
521	NC_011981	TTC	2	6	32437	32442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102436
522	NC_011981	TCA	2	6	32469	32474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102436
523	NC_011981	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	222102436
524	NC_011981	GATTTG	2	12	32525	32536	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222102436
525	NC_011981	AT	3	6	32546	32551	50 %	50 %	0 %	0 %	222102436
526	NC_011981	CG	3	6	32601	32606	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
527	NC_011981	CAG	2	6	32659	32664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102436
528	NC_011981	AAT	2	6	32689	32694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102436
529	NC_011981	CGGG	2	8	32710	32717	0 %	0 %	75 %	25 %	222102436
530	NC_011981	CGG	2	6	32772	32777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102436
531	NC_011981	TC	3	6	32839	32844	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
532	NC_011981	TGC	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102436
533	NC_011981	TTG	3	9	33194	33202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102436
534	NC_011981	TTCG	2	8	33226	33233	0 %	50 %	25 %	25 %	222102436
535	NC_011981	GCA	2	6	33240	33245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102436
536	NC_011981	CAC	2	6	33850	33855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102437
537	NC_011981	GGC	2	6	33933	33938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102437
538	NC_011981	CAT	2	6	33947	33952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102437
539	NC_011981	GCA	2	6	33972	33977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
540	NC_011981	CGC	2	6	33986	33991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102437
541	NC_011981	GCT	3	9	34010	34018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102437
542	NC_011981	CGA	2	6	34031	34036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
543	NC_011981	GAG	2	6	34140	34145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102437
544	NC_011981	GC	3	6	34236	34241	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
545	NC_011981	AGC	2	6	34258	34263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
546	NC_011981	CGC	3	9	34277	34285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102437
547	NC_011981	GAA	2	6	34313	34318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102437
548	NC_011981	GAA	2	6	34328	34333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102437
549	NC_011981	GTG	2	6	34352	34357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102437
550	NC_011981	CGA	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
551	NC_011981	CCG	2	6	34468	34473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102437
552	NC_011981	ACC	2	6	34491	34496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102437
553	NC_011981	GCA	2	6	34520	34525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
554	NC_011981	TGGC	2	8	34530	34537	0 %	25 %	50 %	25 %	222102437
555	NC_011981	CAA	2	6	34538	34543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102437
556	NC_011981	GGCCA	2	10	34584	34593	20 %	0 %	40 %	40 %	222102437
557	NC_011981	CTGC	2	8	34596	34603	0 %	25 %	25 %	50 %	222102437
558	NC_011981	TGACC	2	10	34640	34649	20 %	20 %	20 %	40 %	222102437
559	NC_011981	CG	3	6	34664	34669	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
560	NC_011981	AAG	2	6	34713	34718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102437
561	NC_011981	TCG	2	6	34756	34761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102437
562	NC_011981	AGG	2	6	34762	34767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102437
563	NC_011981	CGGA	2	8	34830	34837	25 %	0 %	50 %	25 %	222102437
564	NC_011981	CG	3	6	34856	34861	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
565	NC_011981	GAC	2	6	34875	34880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
566	NC_011981	TGC	2	6	34982	34987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102437
567	NC_011981	CTG	2	6	35034	35039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102437
568	NC_011981	GC	3	6	35046	35051	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
569	NC_011981	CG	3	6	35108	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
570	NC_011981	GAC	2	6	35204	35209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
571	NC_011981	CGG	2	6	35218	35223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102437
572	NC_011981	CG	3	6	35256	35261	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
573	NC_011981	GCT	2	6	35309	35314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102437
574	NC_011981	GAC	2	6	35328	35333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
575	NC_011981	GGA	2	6	35378	35383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102437
576	NC_011981	CGA	2	6	35390	35395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102437
577	NC_011981	GTG	2	6	35425	35430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102437
578	NC_011981	CCG	2	6	35446	35451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102437
579	NC_011981	GCC	2	6	35484	35489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102437
580	NC_011981	ATG	2	6	35590	35595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102438
581	NC_011981	GCG	2	6	35625	35630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102438
582	NC_011981	CGA	2	6	35662	35667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102438
583	NC_011981	CGG	2	6	35756	35761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102438
584	NC_011981	CT	3	6	35800	35805	0 %	50 %	0 %	50 %	222102438
585	NC_011981	GAG	2	6	35829	35834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102438
586	NC_011981	CAGT	2	8	35969	35976	25 %	25 %	25 %	25 %	222102438
587	NC_011981	GGT	2	6	36026	36031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102438
588	NC_011981	CCAG	2	8	36056	36063	25 %	0 %	25 %	50 %	222102438
589	NC_011981	TCG	2	6	36067	36072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102438
590	NC_011981	TGGG	2	8	36088	36095	0 %	25 %	75 %	0 %	222102438
591	NC_011981	CGAGG	2	10	36099	36108	20 %	0 %	60 %	20 %	222102438
592	NC_011981	ACG	2	6	36116	36121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102438
593	NC_011981	ATG	2	6	36196	36201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102438
594	NC_011981	GCG	2	6	36225	36230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102438
595	NC_011981	GC	3	6	36692	36697	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
596	NC_011981	CCTCG	2	10	36714	36723	0 %	20 %	20 %	60 %	222102439
597	NC_011981	GCA	2	6	36765	36770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102439
598	NC_011981	CTC	2	6	36791	36796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102439
599	NC_011981	GGGCC	2	10	36816	36825	0 %	0 %	60 %	40 %	222102439
600	NC_011981	GAC	3	9	36870	36878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102439
601	NC_011981	AGA	2	6	36950	36955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102439
602	NC_011981	GC	3	6	36975	36980	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
603	NC_011981	CAC	2	6	36981	36986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102439
604	NC_011981	TCG	2	6	37184	37189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102439
605	NC_011981	CG	3	6	37222	37227	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
606	NC_011981	CAC	2	6	37248	37253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102439
607	NC_011981	AGC	2	6	37448	37453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102439
608	NC_011981	GCA	2	6	37495	37500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102439
609	NC_011981	CCGT	2	8	37609	37616	0 %	25 %	25 %	50 %	222102440
610	NC_011981	TCT	2	6	37648	37653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102440
611	NC_011981	AAG	3	9	37701	37709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102440
612	NC_011981	GCT	2	6	37778	37783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102440
613	NC_011981	ACTG	2	8	37788	37795	25 %	25 %	25 %	25 %	222102440
614	NC_011981	ATC	2	6	37861	37866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102440
615	NC_011981	CGT	2	6	37908	37913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102440
616	NC_011981	TGC	2	6	37979	37984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102440
617	NC_011981	GCC	2	6	38019	38024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102440
618	NC_011981	GGC	2	6	38054	38059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102440
619	NC_011981	TTC	2	6	38151	38156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102440
620	NC_011981	TTG	2	6	38185	38190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102440
621	NC_011981	GAC	2	6	38232	38237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102440
622	NC_011981	TCGGA	2	10	38323	38332	20 %	20 %	40 %	20 %	222102440
623	NC_011981	GCA	2	6	38362	38367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102440
624	NC_011981	TGA	2	6	38408	38413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102440
625	NC_011981	ATG	2	6	38431	38436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102440
626	NC_011981	GTT	2	6	38513	38518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102441
627	NC_011981	CGG	2	6	38579	38584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102441
628	NC_011981	GCA	2	6	38707	38712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102441
629	NC_011981	TTGC	2	8	38823	38830	0 %	50 %	25 %	25 %	222102441
630	NC_011981	GGC	2	6	38858	38863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102441
631	NC_011981	GATG	2	8	38936	38943	25 %	25 %	50 %	0 %	222102441
632	NC_011981	GGTC	2	8	39050	39057	0 %	25 %	50 %	25 %	222102441
633	NC_011981	GGC	2	6	39063	39068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102441
634	NC_011981	GCCTG	2	10	39121	39130	0 %	20 %	40 %	40 %	222102441
635	NC_011981	GGCA	2	8	39173	39180	25 %	0 %	50 %	25 %	222102441
636	NC_011981	ATC	2	6	39285	39290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102441
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641	NC_011981	TTC	2	6	39686	39691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102442
642	NC_011981	TCC	2	6	39747	39752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102442
643	NC_011981	AAC	2	6	39834	39839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102442
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653	NC_011981	GCG	2	6	40649	40654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102444
654	NC_011981	AGA	2	6	40660	40665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102444
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658	NC_011981	GCG	2	6	41029	41034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102444
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661	NC_011981	CGGCG	2	10	41191	41200	0 %	0 %	60 %	40 %	222102445
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665	NC_011981	CAA	2	6	41378	41383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102445
666	NC_011981	GTC	3	9	41512	41520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102446
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668	NC_011981	AGCG	2	8	41709	41716	25 %	0 %	50 %	25 %	222102446
669	NC_011981	GCAG	2	8	41733	41740	25 %	0 %	50 %	25 %	222102446
670	NC_011981	CGG	2	6	41741	41746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102446
671	NC_011981	CGAGCG	2	12	41814	41825	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102446
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702	NC_011981	CGT	2	6	43208	43213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102447
703	NC_011981	TCA	2	6	43299	43304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102447
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712	NC_011981	CGG	3	9	44110	44118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102449
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720	NC_011981	GGCT	2	8	44563	44570	0 %	25 %	50 %	25 %	222102450
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745	NC_011981	GCA	2	6	46154	46159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
746	NC_011981	CGG	2	6	46205	46210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102452
747	NC_011981	TCG	2	6	46216	46221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102452
748	NC_011981	TGG	2	6	46258	46263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102452
749	NC_011981	CGAACA	2	12	46268	46279	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222102452
750	NC_011981	GA	3	6	46303	46308	50 %	0 %	50 %	0 %	222102452
751	NC_011981	GCCA	2	8	46349	46356	25 %	0 %	25 %	50 %	222102452
752	NC_011981	CGA	2	6	46406	46411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
753	NC_011981	CCA	2	6	46457	46462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102452
754	NC_011981	GAG	2	6	46470	46475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102452
755	NC_011981	TCGG	2	8	46489	46496	0 %	25 %	50 %	25 %	222102452
756	NC_011981	TC	3	6	46511	46516	0 %	50 %	0 %	50 %	222102452
757	NC_011981	TTTTC	2	10	46535	46544	0 %	80 %	0 %	20 %	222102452
758	NC_011981	TTCTC	2	10	46606	46615	0 %	60 %	0 %	40 %	222102452
759	NC_011981	TCT	2	6	46642	46647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102452
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763	NC_011981	CGA	2	6	46764	46769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102452
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767	NC_011981	GAG	2	6	46862	46867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102452
768	NC_011981	ATT	2	6	46885	46890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102452
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786	NC_011981	GTTG	2	8	47820	47827	0 %	50 %	50 %	0 %	222102453
787	NC_011981	ATA	2	6	47885	47890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102453
788	NC_011981	GCC	2	6	47895	47900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102453
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982	NC_011981	AC	3	6	59207	59212	50 %	0 %	0 %	50 %	222102461
983	NC_011981	AGAA	2	8	59237	59244	75 %	0 %	25 %	0 %	222102461
984	NC_011981	GAAG	2	8	59250	59257	50 %	0 %	50 %	0 %	222102461
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998	NC_011981	GCTT	2	8	60153	60160	0 %	50 %	25 %	25 %	222102463
999	NC_011981	GGCAA	2	10	60186	60195	40 %	0 %	40 %	20 %	222102463
1000	NC_011981	TGG	2	6	60224	60229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102463

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